Prof Yusril menjawab warganet yang bertanya tentang status pernikahannya dengan istri kedua, Rika Tolentino Kato, yang merupakan wanita berdarah campuran Jepang-Filipina yang memeluk agama Islam pada tahun 2006. Mereka memiliki dua anak, Ishmael Zacharias Mahendra dan Anissa Zulaikha Mahendra. Sebelum menikah dengan Rika, Prof Yusril sudah pernah menikah dengan Kessy Sukaesih, wanita berdarah Sunda-Betawi, namun perkawinan tersebut berakhir dengan perceraian pada tahun 2005. Dari pernikahannya dengan Kessy, Prof Yusril memiliki empat orang anak, yakni Yuri Kemal Fadlullah, Kenia Khairunissa Mahendra, Meilany Alissa, dan Ali Reza Mahendra.
