Kue lapis tepung beras sering kali menghasilkan tekstur yang sangat keras saat sudah dingin. Hal ini disebabkan oleh penggunaan tepung beras tanpa tambahan tepung tapioka atau karena takaran santan yang kurang, membuat adonan terlalu padat saat dikukus. Untuk menghindari lapisan kue lapis yang mudah lepas saat dikelupas, pastikan durasi pengukusan antar lapisan cukup agar lapisan bawah cukup kokoh namun masih sedikit lengket di permukaannya. Kue lapis yang menggunakan santan yang telah direbus dapat bertahan selama 2 hari di suhu ruang, namun lebih baik disimpan di kulkas setelah 24 jam agar aroma santan tetap segar. Jika menggunakan santan instan, pastikan untuk mencampurnya dengan air hingga mencapai volume gelas yang ditentukan, meskipun santan asli masih memiliki rasa gurih yang lebih otentik. Untuk menghindari permukaan kue lapis yang berair dan tidak mulus setelah dikukus, pastikan tutup kukusan selalu dibungkus dengan kain atau serbet yang dapat menyerap uap air selama proses memasak.
