Setelah tiba di onsen, penting untuk mengikuti aturan dan etika yang berlaku. Setelah melepas sepatu di pintu masuk, pastikan untuk menyimpannya di loker sepatu yang disediakan sebelum berjalan tanpa alas kaki. Jika diminta untuk menggunakan sandal yang disediakan, sebaiknya patuhi permintaan tersebut. Onsen biasanya terbagi menjadi bagian pria dan wanita, biasanya ditandai dengan tirai merah untuk wanita dan biru untuk pria. Waspada bahwa bagian ini kadang-kadang dapat diganti setiap hari atau minggu, maka penting untuk berhati-hati saat memasuki area yang benar sesuai jenis kelamin Anda.
Memakai baju renang tidak dianjurkan saat mandi di onsen kecuali di taman hiburan. Jika Anda berada di onsen tradisional, prinsip dasarnya adalah telanjang. Meskipun mungkin terasa canggung pada awalnya, hal ini penting untuk dinikmati sebagai bagian dari pengalaman mandi onsen. Di Jepang, ketelanjangan di bak mandi dianggap sebagai hal yang biasa dan tidak terkait dengan keseksualan atau rasa malu. Ini adalah bentuk penghargaan terhadap kesetaraan dan kesederhanaan, menunjukkan bahwa ketika semua pakaian dilepas, kita semua sama – hanya orang-orang yang menikmati berendam dengan nyaman.